Στην κληρωτίδα θα μπουν οι 16 ομάδες που προκρίθηκαν από τη Β' φάση, μαζί με τις 16 ομάδες της Football League. Θα προκύψουν 16 ζευγάρια, από τα οποία μετά από μονούς αγώνες αποκλεισμού θα προκριθούν 16 ομάδες στη φάση των «32».

Στη διαδικασία της κλήρωσης στην πρώτη κληρωτίδα θα τοποθετηθούν οι ομάδες της Football League και στη δεύτερη κληρωτίδα οι Κυπελλούχες/Φιναλίστ ομάδες των Ε.Π.Σ. Η κλήρωση των ζευγαριών θα ξεκινά από τη δεύτερη κληρωτίδα ώστε γηπεδούχος ομάδα θα είναι υποχρεωτικά Κυπελλούχος/Φιναλίστ Ε.Π.Σ.

Στην εν λόγω φάση εάν το αποτέλεσμα του αγώνα δεν αναδεικνύει νικητή, τότε εφαρμόζονται οι διατάξεις του άρθρου 20 παρ. 12 του Κ.Α.Π.