Το πρωτάθλημα θα διεξαχθεί σε δύο ομίλους και οι ομάδες που θα τερματίσουν στις πρώτες δύο θέσεις της βαθμολογίας θα αγωνιστούν σε αγώνες πλέι οφ, για την ανάδειξη του πρωταθλητή.
Αναλυτικά η ανακοίνωση από τη Football League είναι η εξής: «Σας ενημερώνουμε ότι την Πέμπτη 15 Νοεμβρίου 2018 και ώρα 13:00, θα διεξαχθεί στα γραφεία της Football League (Θεμιστοκλέους 42 – Αθήνα, 4ος όροφος), η κλήρωση του Πρωταθλήματος Football League Νέων αγωνιστικής περιόδου 2018 – 2019».
Υπενθυμίζεται πως στον όμιλο του βορρά θα συμμετάσχει και ο Απόλλων Λάρισας, όπου στην ομάδα της Κ-19 τεχνικός υπεύθυνος είναι ο Γιώργος Καμάκας.