Ηρθε σε μια δύσκολη περίοδο στο υπουργείο και ανέλαβε όχι μόνο το βάρος των Πανελλαδικών Εξετάσεων, αλλά και τη διαχείριση της εκπαίδευσης των προσφυγόπουλων, ένα έργο ιδιαίτερα μεγάλο και «με αχαρτογράφητες πτυχές», όπως ακριβώς και το μεταναστευτικό.
Ο Γιάννης Παντής, 60 ετών, είχε υποστεί ανακοπή καρδιάς στις 18 Μαΐου και νοσηλευόταν μέχρι σήμερα σε μονάδα εντατικής θεραπείας. Ηταν καθηγητής Οικολογίας στο Τμήμα Βιολογίας του ΑΠΘ. Είχε αναλάβει γενικός γραμματέας μετά την ανάληψη του χαρτοφυλακίου της Παιδείας από τον Νίκο Φίλη, τον Σεπτέμβριο του 2015. «Με οδύνη πληροφορήθηκα την απώλεια του Γιάννη Παντή. Μια απώλεια δύσκολη στη διαχείρισή της σε επίπεδο προσωπικό γιατί εκτός από συνεργάτης ο Γιάννης ήταν και ένας καλός φίλος», ανέφερε ο υπουργός Κώστας Γαβρόγλου, προσθέτοντας: «Η πορεία του, οι επιλογές του, η στάση του στη ζωή θα αποτελούν παραδείγματα άσκησης του ακαδημαϊκού λειτουργήματος και της πολιτικής με καθοριστικά προτάγματα την ηθική και την αποτελεσματικότητα. Ήταν ένας άνθρωπος με πάθος για την εκπαίδευση και πρωτοπόρος στην εισαγωγή καινοτόμων οικολογικών δράσεων στο Πανεπιστήμιο. Με το πάθος του αυτό άφησε παρακαταθήκες πολλές ακόμη και σε όσους δεν τον γνώρισαν προσωπικά αλλά ως επισκέπτες στο Υπουργείο θα βλέπουν για πάντα τα έργα που με τόσο πάθος ο Γιάννης φρόντισε να κοσμήσουν τον χώρο του Υπουργείου, ανασύροντάς τα από τα υπόγεια της Σχολής Καλών Τεχνών. Το Υπουργείο Παιδείας είναι φτωχότερο χωρίς αυτόν. Στέλνω τα θερμά μου συλλυπητήρια στην οικογένειά του και συμμετέχω στη μεγάλη θλίψη τους». Τα συλλυπητήριά του στην οικογένεια του εκλιπόντος εξέφρασε και ο Αναπληρωτής Υπουργός Έρευνας και Καινοτομίας, Κώστας Φωτάκης.