Ο Μόρσι ήταν πρόεδρος της χώρας από τις 30 Ιουνίου 2012 έως τις 3 Ιουλίου 2013, όταν ο στρατηγός Αμπντέλ Φατάχ αλ- Σίσι τον ανέτρεψε, έπειτα από σφοδρές και αιματηρές διαδηλώσεις στην Αίγυπτο. Μετά την ανατροπή του, ο Μόρσι συνελήφθη και αντιμετώπισε πληθώρα κατηγοριών, ανάμεσά τους για προτροπή σε βία και κατασκοπεία. Αρχικά καταδικάστηκε σε θάνατο, αλλά το δευτεροβάθμιο δικαστήριο είχε ακυρώσει τη θανατική ποινή. Είχε ήδη καταδικαστεί σε ισόβια κάθειρξη.