Ο Φορέας Διαχείρισης Π.Ο.Κα.Μα.Κε.Βε. παράλληλα με την παρακολούθηση που διενεργεί σε συνεργασία με τη Δ.Ε.Υ.Α. Λάρισας πρότεινε και ζήτησε από το Υ.Π.ΕΝ. την υπαγωγή της Κάρλας σε εξειδικευμένο πρόγραμμα παρακολούθησης όσον αφορά στα ποιοτικά χαρακτηριστικά του νερού και κυρίως τις παραμέτρους που σχετίζονται με την παρουσία ειδικών ρύπων και ουσιών προτεραιότητας όπως π.χ. φυτοφάρμακα, ζιζανιοκτόνα , βιοτοξίνες αλλά και τα βασικά θρεπτικά στοιχεία.
Με δεδομένο τον γεωργοκτηνοτροφικό χαρακτήρα της ευρύτερης περιοχής, ο Φορέας Διαχείρισης έκρινε ότι η τακτική παρακολούθηση των προ αναφερομένων ειδικών ρύπων είναι απαραίτητη προκειμένου να διερευνηθεί η ενδεχόμενη παρουσία τους και η ποσότητά τους με σκοπό τη λήψη των ενδεδειγμένων μέτρων.
Ο Φορέας και το Υ.Π.ΕΝ. συνήψαν πρωτόκολλο συνεργασίας με το ερευνητικό κέντρο Ε.Κ.Ε.Φ.Ε.- Δημόκριτος με αντικείμενο τη διενέργεια εξειδικευμένων εργαστηριακών αναλύσεων. Όσον αφορά σε άλλες ειδικές αναλύσεις (παρασιτολογικές, ιολογικές κ.λ.π) ο Φορέας συνεχίζει τη συνεργασία του με την Κτηνιατρική Σχολή του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας καθώς και με τα αρμόδια δημόσια εργαστήρια. Μετά το πέρας του έργου και την αξιολόγηση των ευρημάτων ο Φορέας Διαχείρισης σε συνεργασία με το εποπτεύον Υπουργείο θα συγκαλέσει ειδική συνάντηση με όλους τους αρμόδιους και εμπλεκόμενους φορείς.